《情深深雨濛濛》是继《还珠格格》先后原班人马打造的新一部爱恨情仇的电视连续剧，电视剧改编自琼瑶的原著小说《烟雨濛濛》，故事以20世纪30年代的上海陆家为故事主轴，是唯一一部涉及抗日战争题材的琼瑶剧。

“九一八”事变后，东北的地方军阀陆振华（寇振海饰）带着一家老小逃亡到上海，在法租界定居。他的九姨太雪琴（王琳饰）为人专横跋扈，将八夫人文佩（徐幸饰）母女、李副官（曹秋根饰）一家逐出陆家。这两家人一时失去经济来源，日子贫困窘迫。文佩的女儿依萍（饰）找上门去向父亲讨要生活费，与雪琴发生冲突，遭父亲鞭打，就此立下了复仇之志。 [4] 

依萍下海

为维持生计，李副官只得去当黄包车夫。一天，他的女儿可云（徐路饰）发病，他前来向文佩求救。但文佩难以帮助李家。依萍见此现状，决定瞒着母亲去大上海舞厅当歌女。在舞厅，她与申报记者书桓（古巨基饰）相识。当她得知书桓是九姨太女儿如萍（林心如饰）的男友，顿生夺人所爱之念。不料在交往中，依萍陷入了情网，与他真诚相爱。

失去了书桓，如萍痛苦异常，然而就在她的身边，书桓的朋友杜飞（苏有朋饰）却悄悄地爱着她。可是，如萍只尊重他的友谊，却拒绝了他的爱情，因为她的心中只有书桓。尽管这样，杜飞仍一往情深。可云的精神病又复发了，在依萍的一再追问下，李副官说出伤害可云的竟是如萍的哥哥尔豪（高鑫饰）。原本依萍不想张扬这件往事，因为那时尔豪与可云毕竟才只有16岁，两小无猜。可是，一天在冲突中，依萍将尔豪拉到李家。尔豪见到可云后，极度震惊。他只知道母亲曾对他说，可云已嫁到广州。此事发生后，尔豪不知道怎么面对现在的恋人方瑜（李钰饰），也不知道怎么面对未来。

梦萍被辱

然而，雪琴认为这是依萍有意和她作对之举，因此她找到她的姘夫魏光雄（王伟平饰），魏光雄派人将依萍狠揍了一顿。舞厅的老大秦五爷（黄达亮饰）想帮依萍查出元凶，可多次努力仍找不出头绪。

依萍、书桓、尔豪、杜飞、方瑜和如萍一起帮助可云唤起对往日的记忆。可云的病逐渐地好了起来，她忘记了死去的孩子，却记起了尔豪。目睹这一切，尔豪的女友方瑜提出了分手，她说她在唤醒可云的时候，也唤醒了自己。可尔豪说，他唤醒可云是面对良心，而不是爱情。此时，有着大小姐脾气的如萍的妹妹梦萍（乐婷婷饰），在舞厅里被人强暴。

书桓投军

一天，书桓偶然看到依萍以前的日记，了解到她强烈的复仇心理，知道她接近他，原来因为他是如萍的男友。这刺痛了书桓的心，他决定与依萍决裂。为了逃避，书桓投身到抗日烽火中，当上了战地记者。这对如萍是个机会，她想念着书桓，决定去前线找他。当如萍在隆隆的炮声中出现在书桓面前时，他惊呆了，同时也被感动了。书桓毫不犹豫地与如萍订婚。

订婚庆典上，依萍前来祝贺，还为他们唱起了《欢乐颂》。歌罢，依萍因饮酒而情绪大变，神志不清，从桥上落水。书桓和李副官将依萍救起，急忙送到医院，但她的生命危在旦夕。书桓悔恨交加，抱着依萍说，他是因为爱她太深，才不能忍受她的“不爱”的。见此情景，如萍觉得自己输定了，决定退出这一场“两个女人的战争”。依萍病愈后，与如萍的恩怨也得到了化解。

姐妹和解

随着两姐妹得和解，雪琴的愤怒和仇恨却与日俱增。当她发现丈夫振华要另购房子与文佩母女一起生活时，不禁怒火中烧，赶到依萍家大吵大闹。依萍原来想跟雪琴和平相处，却被逼得走投无路，终于向父亲说出雪琴与魏光雄私通之事。得到李副官的证实后，振华被激怒了。面对丈夫的审问，雪琴坦然承认尔杰便是他和魏光雄的私生子，并破口大骂陆振华。盛怒之下，振华把雪琴母子关进地窖，说要饿死他们。

如萍、尔豪想尽办法营救母亲和弟弟，奈何父亲盛怒难消，一时束手无策。依萍和书桓出面劝阻，振华为情所动，决定顺水推舟，给如萍以机会营救雪琴母子。如萍在母亲的指点下，找到魏光雄。原来，魏光雄是黑社会中人，他在抢出雪琴母子的同时，还与雪琴密谋将陆家的财产洗劫一空。

眼见自己的母亲居然不顾子女，与姘夫合谋作出此等恶事，如萍大受打击，最终她留下一封家书出走。此时，“七七”卢沟桥事变爆发，原本想一死了之的如萍，在时代的感召下，就此投身到关系民族存亡的战斗中去。

抗战爆发后，书桓、杜飞、尔豪和依萍也投入到全民抗战之中。8年过去了，他们相继重逢。杜飞与如萍是在战场上偶然相见的，因此分外高兴，两人决定在一起生活。而依萍则一直在等待着书桓的归来。