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午夜12点,在繁华都市的一个小角落,一家食堂才刚刚开始营业。这家深夜食堂的老板(小林薰 饰)虽然脸上带着伤疤,却是一个温情且厨艺精湛的男人。虽然小店里的菜谱很简单,但是只要是客人想吃的都可以点,所以小店备受底层小市民的喜爱。延续第一季的风格,深夜食堂里每晚都上演一个耐人寻味的故事,每个故事的主角都有自己钟爱的一款美食。特别值得一提,第一季曾出现的红色香肠再度登场,其中埋藏多年的往事随之揭晓,曾经的故人再度聚首,又展开了一个崭新的温情故事……